2024年度のタイトル戦が開幕。まずは名人戦、叡王戦のダブル防衛戦。棋聖戦の挑戦者は山崎隆之八段に決まり、新鮮で楽しみなシリーズとなった。
※対局予定棋士の名前の後の()内は藤井から見た過去の対戦成績。 歴代タイトル獲得者一覧はこちらから
　
4月7日に第9期叡王戦五番勝負第1局で伊藤匠七段と対戦。藤井が先手で角換わり腰掛け銀から伊藤は右玉へ組み直す。先手は玉頭を直撃されて怖い形での攻め合いとなったが、うまく危険をかいくぐりながら的確に攻め続けて制勝。最後は鮮やかな着地を決めた。
　
4月10、11日に第82期名人戦七番勝負第1局で豊島将之九段と対戦。藤井が先手で力戦調の横歩取りとなる。二日目の夕休憩に入っても差がつかないねじり合いだったが、陣形の差を生かして豊島が少しずつリードを奪う。手堅い指し回しに追い詰められる藤井だったが、終盤に訪れた一瞬のチャンスをとらえて逆転。時間切迫の中でも妙手を逃さず、一気に勝ちに持っていった。
　
4月20日に叡王戦第2局で伊藤七段と対戦。後手の藤井は角換わりから3三金型の早繰り銀を初採用。やや苦しい展開から一時は逆転するものの、最後は的確な寄せを浴びて敗戦。これで五番勝負は1勝1敗に。第3局は5月2日に行われた。
　
4月23、24日に名人戦第2局で豊島九段と対戦。相掛かりから豊島はひねり飛車模様に。藤井は新構想を見せて、少しずつペースをつかんでいく。そのまま押し切るかと思われたが、豊島の粘り強い指し回しの前にいつしか形勢は混沌。一時は逆転も許すが、最後の寄せ合いで抜け出してからくも勝利。七番勝負を2勝0敗とした。第3局は5月8日(水)、9日(木)に行われる。